MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobidae bacterium YM16-304 DNA

Total Repeats: 126297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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126002	NC_020520	CGAGCC	2	12	4818123	4818134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180483
126003	NC_020520	CAG	2	6	4818164	4818169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180483
126004	NC_020520	CGA	2	6	4818178	4818183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180483
126005	NC_020520	CGA	2	6	4818352	4818357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126006	NC_020520	TGG	2	6	4818366	4818371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180484
126007	NC_020520	CGA	2	6	4818478	4818483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126008	NC_020520	TCA	2	6	4818501	4818506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180484
126009	NC_020520	GGTC	2	8	4818536	4818543	0 %	25 %	50 %	25 %	470180484
126010	NC_020520	CCA	2	6	4818573	4818578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470180484
126011	NC_020520	CGA	2	6	4818589	4818594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126012	NC_020520	GAT	2	6	4818635	4818640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470180484
126013	NC_020520	CGA	3	9	4818643	4818651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126014	NC_020520	GGC	2	6	4818656	4818661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470180484
126015	NC_020520	CGA	2	6	4818682	4818687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126016	NC_020520	CGA	2	6	4818733	4818738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126017	NC_020520	CGA	2	6	4818745	4818750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126018	NC_020520	CGA	2	6	4818754	4818759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126019	NC_020520	GTG	2	6	4818773	4818778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180484
126020	NC_020520	CG	4	8	4818862	4818869	0 %	0 %	50 %	50 %	470180484
126021	NC_020520	TCG	2	6	4818918	4818923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180484
126022	NC_020520	GA	3	6	4818946	4818951	50 %	0 %	50 %	0 %	470180484
126023	NC_020520	GCT	2	6	4819044	4819049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180485
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126030	NC_020520	CTCG	2	8	4819326	4819333	0 %	25 %	25 %	50 %	470180485
126031	NC_020520	CGC	2	6	4819339	4819344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180485
126032	NC_020520	CCG	2	6	4819347	4819352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180485
126033	NC_020520	GTG	2	6	4819358	4819363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180485
126034	NC_020520	GCT	2	6	4819377	4819382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180485
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126040	NC_020520	CGA	2	6	4819479	4819484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180485
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126044	NC_020520	CGA	2	6	4819593	4819598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180485
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126051	NC_020520	GAA	2	6	4819693	4819698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470180485
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126113	NC_020520	CGGG	2	8	4821550	4821557	0 %	0 %	75 %	25 %	470180488
126114	NC_020520	CAC	2	6	4821569	4821574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470180488
126115	NC_020520	CAT	2	6	4821608	4821613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180488
126116	NC_020520	CAC	2	6	4821722	4821727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470180488
126117	NC_020520	TTC	3	9	4821855	4821863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470180488
126118	NC_020520	GGT	2	6	4821888	4821893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180488
126119	NC_020520	GGA	2	6	4821908	4821913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470180488
126120	NC_020520	GC	3	6	4821974	4821979	0 %	0 %	50 %	50 %	470180488
126121	NC_020520	AAC	2	6	4822008	4822013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470180488
126122	NC_020520	CGA	2	6	4822061	4822066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180488
126123	NC_020520	TCG	2	6	4822087	4822092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180488
126124	NC_020520	TCA	2	6	4822213	4822218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180488
126125	NC_020520	CCG	3	9	4822303	4822311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180488
126126	NC_020520	GGC	2	6	4822325	4822330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470180488
126127	NC_020520	GCT	2	6	4822463	4822468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126128	NC_020520	CGA	2	6	4822469	4822474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126129	NC_020520	CGA	2	6	4822520	4822525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126130	NC_020520	CGACC	2	10	4822562	4822571	20 %	0 %	20 %	60 %	470180489
126131	NC_020520	CTC	2	6	4822583	4822588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470180489
126132	NC_020520	CGA	2	6	4822600	4822605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126133	NC_020520	GTC	2	6	4822614	4822619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126134	NC_020520	GCT	2	6	4822625	4822630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126135	NC_020520	CCG	2	6	4822639	4822644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180489
126136	NC_020520	ATC	2	6	4822683	4822688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180489
126137	NC_020520	GCT	2	6	4822715	4822720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180489
126138	NC_020520	TC	3	6	4822864	4822869	0 %	50 %	0 %	50 %	470180490
126139	NC_020520	CGA	2	6	4822882	4822887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180490
126140	NC_020520	CGT	3	9	4822912	4822920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180490
126141	NC_020520	AAG	2	6	4822952	4822957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470180490
126142	NC_020520	GAC	2	6	4822994	4822999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180490
126143	NC_020520	CGA	2	6	4823023	4823028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180490
126144	NC_020520	CGA	2	6	4823070	4823075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180490
126145	NC_020520	TGC	2	6	4823414	4823419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180491
126146	NC_020520	GCG	2	6	4823420	4823425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470180491
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126151	NC_020520	CGA	2	6	4823520	4823525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180491
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126153	NC_020520	CGG	2	6	4823703	4823708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470180491
126154	NC_020520	CG	3	6	4823721	4823726	0 %	0 %	50 %	50 %	470180491
126155	NC_020520	CCGA	2	8	4823770	4823777	25 %	0 %	25 %	50 %	470180491
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126164	NC_020520	CGGA	2	8	4824529	4824536	25 %	0 %	50 %	25 %	470180492
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126166	NC_020520	GCA	2	6	4824632	4824637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180492
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126170	NC_020520	CCG	2	6	4824762	4824767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180492
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126180	NC_020520	GTG	2	6	4825214	4825219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180492
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126194	NC_020520	GCT	2	6	4825747	4825752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180493
126195	NC_020520	CGA	2	6	4825813	4825818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180493
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126200	NC_020520	CGC	2	6	4826026	4826031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180493
126201	NC_020520	GGGCC	2	10	4826071	4826080	0 %	0 %	60 %	40 %	470180493
126202	NC_020520	TGA	2	6	4826482	4826487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470180494
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126207	NC_020520	CGAC	2	8	4826620	4826627	25 %	0 %	25 %	50 %	470180494
126208	NC_020520	TCGA	2	8	4826660	4826667	25 %	25 %	25 %	25 %	470180494
126209	NC_020520	ACG	2	6	4826687	4826692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180494
126210	NC_020520	TGC	2	6	4826724	4826729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180494
126211	NC_020520	ACC	2	6	4826772	4826777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470180494
126212	NC_020520	CGA	2	6	4826803	4826808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180494
126213	NC_020520	TCAGCG	2	12	4826872	4826883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180494
126214	NC_020520	GTC	2	6	4826894	4826899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180494
126215	NC_020520	CAC	2	6	4826939	4826944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470180494
126216	NC_020520	ACGATG	2	12	4827056	4827067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180495
126217	NC_020520	TCG	2	6	4827080	4827085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180495
126218	NC_020520	CGA	2	6	4827151	4827156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180495
126219	NC_020520	GAC	2	6	4827294	4827299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180495
126220	NC_020520	AC	3	6	4827309	4827314	50 %	0 %	0 %	50 %	470180495
126221	NC_020520	CCG	2	6	4827347	4827352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180495
126222	NC_020520	CGA	2	6	4827357	4827362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180495
126223	NC_020520	GCG	2	6	4827476	4827481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470180495
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.